تُستخدم ®Trio ExomeXtra لتشخيص مريض مصاب لديه أبوين غير مصابين. يزيد تضمين الأبوين غير المصابين في التحليل من فرص الحصول على تشخيص ناجح بشكل كبير. بالنسبة لـ ®Trio ExomeXtra، يتم تسلسل الأكسومات للأبوين وللمريض المصاب. وهذا يسمح بتحليل التفرقة في جميع الأكسومات وبالتالي يُعدل معدل الحلول. تعتبر التشخيصات المقارنة للأكسومات فعّالة بشكل خاص لأن عدد العوامل المتغيرة المراد تقييمها يتم تقليله، ويتم تجنب التحاليل الفردية للتفرقة المتعددة والمكلفة. بالإضافة إلى SNVs و CNVs، نتحقق أيضًا من الانحرافات الأحادية الأمشاج (UPD)، التي تغطي كل من الانحرافات المتجانبة والمتنوعة التي تؤثر على كامل أو جزء من الصبغيات.
يشمل المناطق الإنترونية والبينية والإكسونات الخفية وفحص العدد المتغير للنسخ
تغطية جميع المناطق المعروفة التي تسبب الأمراض في جميع أنحاء الجينوم
تم إعداده بواسطة فريقنا المتعدد التخصصات من الخبراء
متوسط تغطية التشخيص أكثر من 100 مرة
الشكل 1: تمثيل تخطيطي لتصفية الإكسوم الثلاثي، والذي يأخذ في الاعتبار أيضًا الآباء المتأثرين بشكل خفيف. تمكين التصفية ببدائل الوالدين، على سبيل المثال، من اكتشاف بدائل المركب المتنحي.
في عملية التقييم، يقوم فريقنا ذو الخبرة بدراسة جميع البديلات وفقًا لأحدث المعرفة العلمية. بالنسبة للبديلات في الجينات التي ليست مرتبطة بوضوح بظاهرة المريض المشتبه بها، نتنبأ بالمساهمة المحتملة من خلال البحث الأدبي الإضافي الشامل. إذا وجدنا دليلاً على أن بديلًا لم يوصف بعد يسهم في ظاهرة المريض، فإن هذا البديل يُوضَّح في تقريرنا الطبي. يسمح لنا مقارنة بيانات المريض المتأثر ببيانات الوالدين غير المتأثرين (الشكل 1) بتحديد تالي:
في تشخيص الإكسوم العائلي المقارن، يتم تسلسل ليس فقط المريض المتأثر ولكن أيضًا أفراد العائلة الآخرين. يعتبر التحليل الثلاثي للإكسوم هو الأكثر شيوعًا: يشمل ذلك تضمين كلا الوالدين غير المتأثرين للمريض الرئيسي، مما يزيد بشكل كبير من فرص النجاح التشخيصي ليصل إلى ضعف ما هو عليه مقارنة بتشخيص الإكسوم الفردي.
في الحالات العائلية حيث لا يمكن الحصول على عينة من كلا الوالدين البيولوجيين، أو عندما يكون أحد الوالدين متأثرًا أيضًا، فإن خط أنابيب ®ExomeXtra البيوانفورماتيكي التكيفي يسمح لنا بتحليل جميع أنواع التكوينات العائلية، مثل الثنائيات. يتجاوز هذا التحليل الشائع للبدائل الخاصة والمشتركة بين شخصين.
تحليلاتنا الإضافية هي أفضل نهج لحل الحالات التي تشمل والدًا واحدًا (متأثرًا أو غير متأثر) أو أي تكوينات أخرى تتعلق بالفهرس. تعتمد التفسير الدقيق والناجح للبيانات على وصف ظاهري مفصل لجميع الأفراد المتأثرين. تعتمد التشخيصات الثلاثية القياسية للإكسوم على فرضية أن كلا الوالدين غير متأثرين. هذا التصفية تتجاهل أن بعض الآباء يكونون متأثرين بشكل طفيف فقط، مما قد يؤدي إلى نتائج سلبية. نحن نعوض عن هذه الحالات باستراتيجية تحليل فريدة تسمح لنا بحل الحالات التي يكون فيها الظاهرة ناتجة عن بدائل ذات:
نحن نكشف ونبلغ أيضًا عن اضطرابات أحادية الوالدية (UPD). يمكن أن تسبب UPDs أمراضًا بسبب تأثيرات الطبع الجيني، أو وجود طفرات ممرضة متماثلة، أو خلل الصيغة الصبغية الفسيفسائية منخفض المستوى. نحن قادرون على الإبلاغ عن جميع التكوينات الأربعة الممكنة لـ UPD:
CeGaT Trio Exome Sample Report (pdf)
Copyright © 2024 German Genetics Services by CeGaT - All Rights Reserved.
Powered by CeGaT